Activités de recherche

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Activités de recherche

Vous trouverez dans cette section les informations concernant les projets de recherche et nos publications scientifiques. En 2022, le CIRM est impliqué dans 25 projets financés par l'Union européenne, les régions et divers acteurs nationaux (ANR, Industriels, FUI, GIS Ibisa ...).

Caractériser la biodiversité des collections, de la taxonomie aux activités biologiques.

Le CIRM est engagé dans des projets de recherche pour évaluer la biodiversité de ses collections et les potentiels enzymatiques, métaboliques ou biologiques associés. Ces objectifs requièrent un effort de séquençage systématique des génomes et de caractérisation phénotypique faisant appel à des dispositifs de criblage automatisés. Il participe également à l'exploration de la biodiversité microbienne présente dans les environnements d'intérêt agronomique et environnemental.

  • Génomique : Taxonomie / phylogénomique / recherche de gènes et potentiel enzymatique / profilage métabolique / déréplication / Ensemble de souches de référence
  • Métabolisme – Activité enzymatique :  Métabolisme des oligosaccharides  / production de vitamines, d’exopolysaccharides, de composés aromatiques / activités cellulolytique / dégradation de polluants d'origine industrielle
  • Activité biologique  Activité antifongique / production de bactériocines / profils de résistance aux antibiotiques selon les procédures EUCAST/CASFM / propriétés anti-inflammatoires.

Publications récentes :

  • Large-scale phenotyping of 1,000 fungal strains for the degradation of non-natural, industrial compounds Commun Biol . 2021 Jul 15;4(1):871.  doi: 10.1038/s42003-021-02401-w.
  • Quantifying the effect of human practices on S. cerevisiae vineyard metapopulation diversity Sci Rep . 2020 Oct 1;10(1):16214.  doi: 10.1038/s41598-020-73279-7.
  • Microbial Diversity Associated with Gwell, a Traditional French Mesophilic Fermented Milk Inoculated with a Natural Starter  Microorganisms . 2020 Jun 30;8(7):982. doi: 10.3390/microorganisms8070982

Date de modification : 31 juillet 2023 | Date de création : 27 octobre 2021 | Rédaction : MINEAU-CESARI Jonathan